Кафедра профпатологии и гематологии была создана профессором В.Я. Шустовым в 1964 году. В 1970 году была организована Клиника профпатологии и гематологии, ставшая клинической, учебной и научно-исследовательской базой кафедры. Все это позволило в рамках Саратовского медицинского института создать учебно-научно-практическое объединение профпатологии и гематологии, приблизить научные достижения к практической медицине, обеспечить перспективные методы их внедрения. Более четверти века заслуженный врач РСФСР, профессор В.Я. Шустов возглавлял созданные им кафедру и клинику. Более чем за 35 лет научной работы им опубликовано около 250 научных трудов по гематологии, профпатологии, внутренним болезням, организации здравоохранения, 20 рационализаторских предложений и 3 изобретения. В.Я Шустов являлся автором двух учебников „Клиническая гематология“ и „Профессиональные заболевания“.
С 1996 по 2004 кафедру возглавлял д.м.н., профессор А. Д. Трубецков. Под его руководством проводились исследования патологии при различных формах вахтового и сменного труда, профессионально обусловленных заболеваний у рабочих различных производств. Под редакцией профессора А.Д. Трубецкова издано учебное пособие „Профессиональные болезни и гематология“.
С 2004 года по настоящее время заведующей кафедрой является д.м.н., профессор, Т.В. Шелехова. Под руководством Т.В. Шелеховой проводится изучение онкогематологических заболеваний, в том числе молекулярно-биологических маркеров опухолевой прогрессии, клинико- фармакологических аспектов множественной миеломы, хронического лимфоцитарного лейкоза, изучение системы гемостаза, фармакогенетические и фармакоэкономические исследования. Продолжаются исследования воздействия факторов малой интенсивности на организм работающих в условиях современного производства, исследования заболеваний легких профессионального генеза, остеопороза, патологии опорно-двигательного аппарата у ликвидаторов последствий аварии на Чернобыльской АЭС.
Результатами научной деятельности коллектива кафедры под руководством д.м.н., профессора Т.В. Шелеховой являются 7 кандидатских и 1 докторская диссертации; 8 учебных пособий, 40 учебно-методических рекомендаций, а также более 250 публикаций в отечественной и зарубежной печати; внедрение в практику результатов многоцентровых рандомизированных клинических исследований, проводимых на базе кафедры с 2004 года, разработка и проведение протоколов клинических апробаций у пациентов с гемобластозами.
В 2015 году произошло объединение кафедры профпатологии и гематологии с кафедрой клинической фармакологии.
Как самостоятельная кафедра клинической фармакологии СГМУ была организована в 1987 году по приказу Министерства здравоохранения и ректора СМИ член-корреспондента РАМН Н.Р. Иванова. Первой лечебной базой кафедры клинической фармакологии была МСЧ завода „Корпус“ со 150-коечным стационаром и поликлиникой. Возглавляла кафедру д.м.н., профессор С.И. Богословская. В течение 10 лет на кафедре проводились научные исследования совместно с Институтом органического синтеза Академии наук Латвийской ССР по изучению принципиально новой группы дигидропиридиновых производных, изучалась связь структуры с действием. Длительное время кафедра клинической фармакологии занималась клинико-фармакоэкономическими научными исследованиями артериальной гипертензии, язвенной болезни, остеопороза, совместно с кафедрой профпатологии и гематологии. Под руководством д.м.н., профессора С.И. Богословской выполнены 15 кандидатских и 2 докторские диссертационные работы, издано 28 учебно-методических пособий, 10 монографий.
В настоящее время кафедра профпатологии, гематологии и клинической фармакологии, возглавляемая д.м.н., профессором Т.В. Шелеховой, располагается на базе Университетской клинической больницы №3 имени В.Я. Шустова.